Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NFKBIEO00221 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NFKBIEO00221 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NFKBIEO00221 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NFKBIEO00221 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NFKBIEO00221 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NFKBIEO00221 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NFKBIEO00221 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NFKBIEO00221 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NFKBIEO00221 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
NFKBIEO00221 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NFKBIEO00221 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
NFKBIEO00221 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NFKBIEO00221 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NFKBIEO00221 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NFKBIEO00221 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
NFKBIEO00221 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NFKBIEO00221 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NFKBIEO00221 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NFKBIEO00221 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
NFKBIEO00221 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
NFKBIEO00221 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
NFKBIEO00221 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NFKBIEO00221 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms