Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGPSO00116 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
AGPSO00116 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
AGPSO00116 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGPSO00116 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
AGPSO00116 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AGPSO00116 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGPSO00116 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGPSO00116 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGPSO00116 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGPSO00116 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGPSO00116 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
AGPSO00116 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGPSO00116 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGPSO00116 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGPSO00116 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
AGPSO00116 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
AGPSO00116 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGPSO00116 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AGPSO00116 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGPSO00116 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGPSO00116 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AGPSO00116 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
AGPSO00116 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AGPSO00116 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGPSO00116 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AGPSO00116 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGPSO00116 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AGPSO00116 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGPSO00116 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGPSO00116 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGPSO00116 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGPSO00116 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGPSO00116 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AGPSO00116 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGPSO00116 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGPSO00116 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGPSO00116 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AGPSO00116 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGPSO00116 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AGPSO00116 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGPSO00116 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AGPSO00116 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGPSO00116 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AGPSO00116 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AGPSO00116 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGPSO00116 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGPSO00116 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AGPSO00116 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGPSO00116 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AGPSO00116 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AGPSO00116 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGPSO00116 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AGPSO00116 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGPSO00116 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
AGPSO00116 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGPSO00116 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGPSO00116 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGPSO00116 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
AGPSO00116 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGPSO00116 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AGPSO00116 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
AGPSO00116 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGPSO00116 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGPSO00116 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGPSO00116 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGPSO00116 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AGPSO00116 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGPSO00116 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGPSO00116 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGPSO00116 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGPSO00116 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGPSO00116 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGPSO00116 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGPSO00116 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGPSO00116 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AGPSO00116 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AGPSO00116 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AGPSO00116 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AGPSO00116 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGPSO00116 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGPSO00116 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGPSO00116 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGPSO00116 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGPSO00116 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGPSO00116 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGPSO00116 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AGPSO00116 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AGPSO00116 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AGPSO00116 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AGPSO00116 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
AGPSO00116 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AGPSO00116 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AGPSO00116 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AGPSO00116 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AGPSO00116 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AGPSO00116 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AGPSO00116 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AGPSO00116 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AGPSO00116 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms