Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVH48-1M5A8F1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVH48-1M5A8F1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERVH48-1M5A8F1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVH48-1M5A8F1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVH48-1M5A8F1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVH48-1M5A8F1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms