Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm20878L7N244 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm20878L7N244 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20878L7N244 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20878L7N244 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm20878L7N244 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm20878L7N244 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20878L7N244 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20878L7N244 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20878L7N244 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20878L7N244 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20878L7N244 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20878L7N244 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20878L7N244 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20878L7N244 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20878L7N244 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20878L7N244 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gm20878L7N244 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm20878L7N244 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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