Protein–RNA interactions for Protein: K7N6B6

Vmn1r168, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r168K7N6B6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r168K7N6B6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn1r168K7N6B6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn1r168K7N6B6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn1r168K7N6B6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn1r168K7N6B6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn1r168K7N6B6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn1r168K7N6B6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vmn1r168K7N6B6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms