Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6176J3QK59 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm6176J3QK59 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm6176J3QK59 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6176J3QK59 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6176J3QK59 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms