Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Vmn1r34G3XA52 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Vmn1r34G3XA52 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vmn1r34G3XA52 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Vmn1r34G3XA52 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Vmn1r34G3XA52 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmn1r34G3XA52 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms