Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Zkscan2G3X952 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zkscan2G3X952 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Zkscan2G3X952 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zkscan2G3X952 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Zkscan2G3X952 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zkscan2G3X952 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Zkscan2G3X952 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zkscan2G3X952 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Zkscan2G3X952 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Zkscan2G3X952 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zkscan2G3X952 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zkscan2G3X952 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zkscan2G3X952 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Zkscan2G3X952 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zkscan2G3X952 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zkscan2G3X952 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zkscan2G3X952 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zkscan2G3X952 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Zkscan2G3X952 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zkscan2G3X952 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zkscan2G3X952 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zkscan2G3X952 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms