Protein–RNA interactions for Protein: F7D043

Gm10770, Predicted gene 10770, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10770F7D043 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10770F7D043 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10770F7D043 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10770F7D043 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10770F7D043 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10770F7D043 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10770F7D043 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10770F7D043 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10770F7D043 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10770F7D043 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10770F7D043 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10770F7D043 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10770F7D043 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10770F7D043 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms