Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
H2-M1F7CXU4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H2-M1F7CXU4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2-M1F7CXU4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-M1F7CXU4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
H2-M1F7CXU4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
H2-M1F7CXU4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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