Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28048F7BCN0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28048F7BCN0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm28048F7BCN0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28048F7BCN0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28048F7BCN0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm28048F7BCN0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28048F7BCN0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm28048F7BCN0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm28048F7BCN0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm28048F7BCN0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm28048F7BCN0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm28048F7BCN0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm28048F7BCN0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm28048F7BCN0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm28048F7BCN0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms