Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rhox13F6YCR7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rhox13F6YCR7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rhox13F6YCR7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox13F6YCR7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox13F6YCR7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rhox13F6YCR7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox13F6YCR7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox13F6YCR7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rhox13F6YCR7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rhox13F6YCR7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rhox13F6YCR7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rhox13F6YCR7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rhox13F6YCR7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms