Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp946F6VWU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp946F6VWU8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp946F6VWU8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp946F6VWU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp946F6VWU8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp946F6VWU8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp946F6VWU8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp946F6VWU8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp946F6VWU8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp946F6VWU8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp946F6VWU8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp946F6VWU8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp946F6VWU8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zfp946F6VWU8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp946F6VWU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms