Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf6F6VAN0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atf6F6VAN0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atf6F6VAN0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atf6F6VAN0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atf6F6VAN0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf6F6VAN0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf6F6VAN0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atf6F6VAN0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf6F6VAN0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atf6F6VAN0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atf6F6VAN0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atf6F6VAN0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atf6F6VAN0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atf6F6VAN0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf6F6VAN0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf6F6VAN0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf6F6VAN0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atf6F6VAN0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atf6F6VAN0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atf6F6VAN0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atf6F6VAN0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atf6F6VAN0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atf6F6VAN0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms