Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm28305F6U473 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm28305F6U473 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm28305F6U473 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm28305F6U473 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm28305F6U473 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm28305F6U473 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms