Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Syngap1F6SEU4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syngap1F6SEU4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Syngap1F6SEU4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Syngap1F6SEU4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Syngap1F6SEU4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Syngap1F6SEU4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Syngap1F6SEU4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms