Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc74aE9Q9U8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc74aE9Q9U8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc74aE9Q9U8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc74aE9Q9U8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc74aE9Q9U8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc74aE9Q9U8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms