Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ankrd35E9Q9D8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ankrd35E9Q9D8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ankrd35E9Q9D8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ankrd35E9Q9D8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ankrd35E9Q9D8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ankrd35E9Q9D8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ankrd35E9Q9D8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ankrd35E9Q9D8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ankrd35E9Q9D8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ankrd35E9Q9D8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ankrd35E9Q9D8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ankrd35E9Q9D8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ankrd35E9Q9D8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ankrd35E9Q9D8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ankrd35E9Q9D8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ankrd35E9Q9D8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ankrd35E9Q9D8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ankrd35E9Q9D8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ankrd35E9Q9D8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ankrd35E9Q9D8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ankrd35E9Q9D8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ankrd35E9Q9D8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ankrd35E9Q9D8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ankrd35E9Q9D8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms