Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Col22a1E9Q7P1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Col22a1E9Q7P1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Col22a1E9Q7P1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col22a1E9Q7P1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Col22a1E9Q7P1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Col22a1E9Q7P1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Col22a1E9Q7P1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Col22a1E9Q7P1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms