Protein–RNA interactions for Protein: E9Q366

Speer4f2, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4f2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f2E9Q366 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Speer4f2E9Q366 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Speer4f2E9Q366 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Speer4f2E9Q366 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Speer4f2E9Q366 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Speer4f2E9Q366 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Speer4f2E9Q366 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Speer4f2E9Q366 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms