Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep350E9Q309 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cep350E9Q309 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cep350E9Q309 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cep350E9Q309 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cep350E9Q309 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cep350E9Q309 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cep350E9Q309 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cep350E9Q309 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cep350E9Q309 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cep350E9Q309 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cep350E9Q309 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms