Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrp3E9Q1T6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrp3E9Q1T6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrp3E9Q1T6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrp3E9Q1T6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lrp3E9Q1T6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp3E9Q1T6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrp3E9Q1T6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lrp3E9Q1T6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp3E9Q1T6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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