Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0A8

Krtap20-2, Keratin-associated protein 20-2, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap20-2E9Q0A8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Krtap20-2E9Q0A8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Krtap20-2E9Q0A8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Krtap20-2E9Q0A8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Krtap20-2E9Q0A8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Krtap20-2E9Q0A8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.1 ms