Protein–RNA interactions for Protein: E9PXN0

Gm8180, Predicted gene 8180, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8180E9PXN0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8180E9PXN0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm8180E9PXN0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm8180E9PXN0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm8180E9PXN0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm8180E9PXN0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm8180E9PXN0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8180E9PXN0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms