Protein–RNA interactions for Protein: E9PJ23

NPIPB6, Nuclear pore complex-interacting protein family member B6, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB6E9PJ23 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NPIPB6E9PJ23 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPIPB6E9PJ23 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NPIPB6E9PJ23 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPIPB6E9PJ23 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPIPB6E9PJ23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms