Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E9PBE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E9PBE3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E9PBE3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E9PBE3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
E9PBE3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E9PBE3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E9PBE3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
E9PBE3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E9PBE3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E9PBE3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E9PBE3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PBE3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
E9PBE3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PBE3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PBE3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PBE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
E9PBE3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PBE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E9PBE3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PBE3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E9PBE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PBE3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PBE3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PBE3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E9PBE3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PBE3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PBE3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PBE3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PBE3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PBE3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PBE3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E9PBE3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PBE3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PBE3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PBE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PBE3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E9PBE3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E9PBE3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PBE3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E9PBE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E9PBE3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PBE3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PBE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PBE3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PBE3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PBE3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PBE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
E9PBE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PBE3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PBE3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PBE3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E9PBE3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PBE3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PBE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PBE3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E9PBE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PBE3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PBE3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PBE3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PBE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E9PBE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PBE3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PBE3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
E9PBE3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PBE3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PBE3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E9PBE3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E9PBE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E9PBE3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E9PBE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
E9PBE3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PBE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PBE3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PBE3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E9PBE3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PBE3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E9PBE3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PBE3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PBE3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PBE3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PBE3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
E9PBE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PBE3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PBE3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
E9PBE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PBE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PBE3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
E9PBE3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PBE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PBE3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PBE3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PBE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
E9PBE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PBE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
E9PBE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PBE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PBE3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
E9PBE3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
E9PBE3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms