Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Piezo1E2JF22 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Piezo1E2JF22 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Piezo1E2JF22 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Piezo1E2JF22 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Piezo1E2JF22 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Piezo1E2JF22 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Piezo1E2JF22 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Piezo1E2JF22 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Piezo1E2JF22 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.7 ms