Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem200bD3Z0P8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem200bD3Z0P8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Tmem200bD3Z0P8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem200bD3Z0P8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem200bD3Z0P8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem200bD3Z0P8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem200bD3Z0P8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem200bD3Z0P8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem200bD3Z0P8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem200bD3Z0P8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem200bD3Z0P8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200bD3Z0P8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem200bD3Z0P8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms