Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm17333C6EQI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm17333C6EQI3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm17333C6EQI3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gm17333C6EQI3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gm17333C6EQI3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Gm17333C6EQI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms