Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZ34

SHISA8, Putative protein shisa-8, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA8B8ZZ34 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SHISA8B8ZZ34 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SHISA8B8ZZ34 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SHISA8B8ZZ34 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SHISA8B8ZZ34 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHISA8B8ZZ34 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHISA8B8ZZ34 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SHISA8B8ZZ34 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms