Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Syce3B5KM66 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Syce3B5KM66 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Syce3B5KM66 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syce3B5KM66 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syce3B5KM66 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Syce3B5KM66 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syce3B5KM66 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syce3B5KM66 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syce3B5KM66 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syce3B5KM66 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syce3B5KM66 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syce3B5KM66 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syce3B5KM66 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syce3B5KM66 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Syce3B5KM66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syce3B5KM66 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Syce3B5KM66 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Syce3B5KM66 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms