Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DSR2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DSR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DSR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DSR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DSR2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DSR2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DSR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DSR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4DSR2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4DSR2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DSR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DSR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DSR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DSR2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DSR2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DSR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DSR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DSR2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
B4DSR2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DSR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DSR2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DSR2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DSR2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
B4DSR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DSR2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DSR2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DSR2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
B4DSR2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DSR2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DSR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DSR2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
B4DSR2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DSR2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DSR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DSR2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DSR2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DSR2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
B4DSR2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DSR2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DSR2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DSR2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
B4DSR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DSR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DSR2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DSR2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DSR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DSR2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DSR2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DSR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DSR2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DSR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DSR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DSR2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
B4DSR2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DSR2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DSR2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
B4DSR2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DSR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DSR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DSR2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DSR2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DSR2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DSR2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DSR2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DSR2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DSR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DSR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DSR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DSR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DSR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DSR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DSR2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DSR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DSR2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
B4DSR2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
B4DSR2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DSR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DSR2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DSR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DSR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DSR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DSR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DSR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DSR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DSR2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DSR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
B4DSR2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DSR2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
B4DSR2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms