Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
Abcc8B2RUS7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC51.54■■■■■ 5.84
Abcc8B2RUS7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
Abcc8B2RUS7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
Abcc8B2RUS7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC51.46■■■■■ 5.83
Abcc8B2RUS7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
Abcc8B2RUS7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.46■■■■■ 5.83
Abcc8B2RUS7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
Abcc8B2RUS7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
Abcc8B2RUS7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.44■■■■■ 5.83
Abcc8B2RUS7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC51.4■■■■■ 5.82
Abcc8B2RUS7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
Abcc8B2RUS7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC51.36■■■■■ 5.81
Abcc8B2RUS7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
Abcc8B2RUS7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.36■■■■■ 5.81
Abcc8B2RUS7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
Abcc8B2RUS7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.8
Abcc8B2RUS7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
Abcc8B2RUS7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
Abcc8B2RUS7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
Abcc8B2RUS7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC51.27■■■■■ 5.8
Abcc8B2RUS7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC51.26■■■■■ 5.8
Abcc8B2RUS7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
Abcc8B2RUS7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
Abcc8B2RUS7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
Abcc8B2RUS7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
Abcc8B2RUS7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC51.15■■■■■ 5.78
Abcc8B2RUS7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
Abcc8B2RUS7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
Abcc8B2RUS7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
Abcc8B2RUS7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.09■■■■■ 5.77
Abcc8B2RUS7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
Abcc8B2RUS7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
Abcc8B2RUS7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
Abcc8B2RUS7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.77
Abcc8B2RUS7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
Abcc8B2RUS7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
Abcc8B2RUS7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC51.01■■■■■ 5.76
Abcc8B2RUS7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.76
Abcc8B2RUS7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC50.99■■■■■ 5.75
Abcc8B2RUS7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
Abcc8B2RUS7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
Abcc8B2RUS7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
Abcc8B2RUS7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
Abcc8B2RUS7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
Abcc8B2RUS7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.96■■■■■ 5.75
Abcc8B2RUS7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.94■■■■■ 5.75
Abcc8B2RUS7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC50.94■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC50.92■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.91■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC50.91■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC50.91■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.89■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC50.88■■■■■ 5.74
Abcc8B2RUS7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC50.87■■■■■ 5.73
Abcc8B2RUS7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.86■■■■■ 5.73
Abcc8B2RUS7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
Abcc8B2RUS7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC50.85■■■■■ 5.73
Abcc8B2RUS7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC50.84■■■■■ 5.73
Abcc8B2RUS7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC50.82■■■■■ 5.73
Abcc8B2RUS7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC50.82■■■■■ 5.73
Abcc8B2RUS7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.73
Abcc8B2RUS7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.81■■■■■ 5.72
Abcc8B2RUS7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.81■■■■■ 5.72
Abcc8B2RUS7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.8■■■■■ 5.72
Abcc8B2RUS7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.78■■■■■ 5.72
Abcc8B2RUS7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.78■■■■■ 5.72
Abcc8B2RUS7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
Abcc8B2RUS7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC50.77■■■■■ 5.72
Abcc8B2RUS7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
Abcc8B2RUS7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC50.75■■■■■ 5.72
Abcc8B2RUS7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
Abcc8B2RUS7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
Abcc8B2RUS7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
Abcc8B2RUS7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
Abcc8B2RUS7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
Abcc8B2RUS7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC50.7■■■■■ 5.71
Abcc8B2RUS7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC50.7■■■■■ 5.71
Abcc8B2RUS7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
Abcc8B2RUS7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC50.69■■■■■ 5.71
Abcc8B2RUS7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
Abcc8B2RUS7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
Abcc8B2RUS7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.66■■■■■ 5.7
Abcc8B2RUS7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
Abcc8B2RUS7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
Abcc8B2RUS7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
Abcc8B2RUS7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.62■■■■■ 5.69
Abcc8B2RUS7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC50.61■■■■■ 5.69
Abcc8B2RUS7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
Abcc8B2RUS7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC50.61■■■■■ 5.69
Abcc8B2RUS7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
Abcc8B2RUS7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.6■■■■■ 5.69
Abcc8B2RUS7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
Abcc8B2RUS7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
Abcc8B2RUS7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC50.57■■■■■ 5.69
Abcc8B2RUS7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC50.56■■■■■ 5.68
Abcc8B2RUS7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.2 ms