Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPBD1B2RD01 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPBD1B2RD01 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPBD1B2RD01 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPBD1B2RD01 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPBD1B2RD01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms