Protein–RNA interactions for Protein: B1AX35

1700011M02Rik, RIKEN cDNA 1700011M02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700011M02RikB1AX35 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700011M02RikB1AX35 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700011M02RikB1AX35 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1700011M02RikB1AX35 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700011M02RikB1AX35 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms