Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Scml2B1AVB3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scml2B1AVB3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scml2B1AVB3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scml2B1AVB3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scml2B1AVB3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scml2B1AVB3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms