Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtpruB1AUH1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PtpruB1AUH1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtpruB1AUH1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PtpruB1AUH1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtpruB1AUH1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PtpruB1AUH1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PtpruB1AUH1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PtpruB1AUH1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PtpruB1AUH1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtpruB1AUH1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtpruB1AUH1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PtpruB1AUH1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtpruB1AUH1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtpruB1AUH1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtpruB1AUH1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PtpruB1AUH1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtpruB1AUH1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtpruB1AUH1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PtpruB1AUH1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PtpruB1AUH1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PtpruB1AUH1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PtpruB1AUH1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtpruB1AUH1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PtpruB1AUH1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PtpruB1AUH1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PtpruB1AUH1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtpruB1AUH1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PtpruB1AUH1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtpruB1AUH1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PtpruB1AUH1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PtpruB1AUH1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtpruB1AUH1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PtpruB1AUH1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PtpruB1AUH1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtpruB1AUH1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtpruB1AUH1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtpruB1AUH1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PtpruB1AUH1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PtpruB1AUH1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PtpruB1AUH1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PtpruB1AUH1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtpruB1AUH1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtpruB1AUH1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtpruB1AUH1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PtpruB1AUH1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
PtpruB1AUH1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PtpruB1AUH1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PtpruB1AUH1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PtpruB1AUH1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
PtpruB1AUH1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms