Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem238A9JSM3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem238A9JSM3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem238A9JSM3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem238A9JSM3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem238A9JSM3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms