Protein–RNA interactions for Protein: A8MXY4

ZNF99, Zinc finger protein 99, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF99A8MXY4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF99A8MXY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF99A8MXY4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF99A8MXY4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZNF99A8MXY4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZNF99A8MXY4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF99A8MXY4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF99A8MXY4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF99A8MXY4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF99A8MXY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms