Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEURL1BA8MQ27 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEURL1BA8MQ27 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NEURL1BA8MQ27 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEURL1BA8MQ27 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NEURL1BA8MQ27 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NEURL1BA8MQ27 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NEURL1BA8MQ27 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NEURL1BA8MQ27 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NEURL1BA8MQ27 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
NEURL1BA8MQ27 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NEURL1BA8MQ27 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEURL1BA8MQ27 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NEURL1BA8MQ27 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NEURL1BA8MQ27 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NEURL1BA8MQ27 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NEURL1BA8MQ27 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEURL1BA8MQ27 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEURL1BA8MQ27 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NEURL1BA8MQ27 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NEURL1BA8MQ27 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEURL1BA8MQ27 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NEURL1BA8MQ27 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NEURL1BA8MQ27 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEURL1BA8MQ27 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEURL1BA8MQ27 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NEURL1BA8MQ27 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NEURL1BA8MQ27 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEURL1BA8MQ27 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NEURL1BA8MQ27 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NEURL1BA8MQ27 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NEURL1BA8MQ27 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NEURL1BA8MQ27 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NEURL1BA8MQ27 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEURL1BA8MQ27 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms