Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC169A6NNP5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC169A6NNP5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC169A6NNP5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC169A6NNP5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC169A6NNP5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC169A6NNP5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC169A6NNP5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms