Protein–RNA interactions for Protein: A6NM36

LRRC30, Leucine-rich repeat-containing protein 30, humanhuman

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC30A6NM36 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LRRC30A6NM36 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LRRC30A6NM36 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRRC30A6NM36 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRC30A6NM36 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LRRC30A6NM36 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LRRC30A6NM36 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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