Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMIM23A6NLE4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMIM23A6NLE4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SMIM23A6NLE4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SMIM23A6NLE4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SMIM23A6NLE4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SMIM23A6NLE4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SMIM23A6NLE4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SMIM23A6NLE4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms