Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN9

ANKUB1, Protein ANKUB1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKUB1A6NFN9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ANKUB1A6NFN9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKUB1A6NFN9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKUB1A6NFN9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKUB1A6NFN9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKUB1A6NFN9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms