Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KLHL33A6NCF5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KLHL33A6NCF5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KLHL33A6NCF5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL33A6NCF5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL33A6NCF5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL33A6NCF5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms