Protein–RNA interactions for Protein: A3KG49

Gm5640, Predicted gene 5640, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5640A3KG49 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm5640A3KG49 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gm5640A3KG49 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5640A3KG49 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5640A3KG49 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gm5640A3KG49 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gm5640A3KG49 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5640A3KG49 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5640A3KG49 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gm5640A3KG49 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm5640A3KG49 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm5640A3KG49 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gm5640A3KG49 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm5640A3KG49 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm5640A3KG49 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms