Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC78A2IDD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC78A2IDD5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC78A2IDD5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC78A2IDD5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC78A2IDD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC78A2IDD5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 245.6 ms