Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn1aA2APX8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scn1aA2APX8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn1aA2APX8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scn1aA2APX8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Scn1aA2APX8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scn1aA2APX8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scn1aA2APX8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scn1aA2APX8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scn1aA2APX8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scn1aA2APX8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn1aA2APX8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn1aA2APX8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Scn1aA2APX8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms