Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34dA2AGU5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34dA2AGU5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn34dA2AGU5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn34dA2AGU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn34dA2AGU5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms