Protein–RNA interactions for Protein: A1L317

Krt24, Keratin, type I cytoskeletal 24, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt24A1L317 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Krt24A1L317 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Krt24A1L317 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Krt24A1L317 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Krt24A1L317 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Krt24A1L317 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Krt24A1L317 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Krt24A1L317 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Krt24A1L317 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Krt24A1L317 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Krt24A1L317 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Krt24A1L317 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Krt24A1L317 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Krt24A1L317 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Krt24A1L317 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Krt24A1L317 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Krt24A1L317 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Krt24A1L317 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Krt24A1L317 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Krt24A1L317 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Krt24A1L317 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Krt24A1L317 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Krt24A1L317 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Krt24A1L317 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Krt24A1L317 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Krt24A1L317 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Krt24A1L317 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Krt24A1L317 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Krt24A1L317 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Krt24A1L317 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Krt24A1L317 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms